Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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