Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms