Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms