Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPL23P62829 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms