Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms