Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCNKBP51801 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms