Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCLMP48507 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCLMP48507 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCLMP48507 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCLMP48507 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCLMP48507 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms