Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GCLCP48506 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCLCP48506 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCLCP48506 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCLCP48506 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCLCP48506 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCLCP48506 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCLCP48506 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCLCP48506 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms