Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms