Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBRP36941 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms