Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms