Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA1P17302 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms