Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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