Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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