Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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TO15178 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TO15178 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TO15178 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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TO15178 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TO15178 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TO15178 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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