Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms