Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TNPO3Q9Y5L0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TNPO3Q9Y5L0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TNPO3Q9Y5L0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNPO3Q9Y5L0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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