Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms