Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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