Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms