Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms