Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DNAJB11Q9UBS4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms