Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL11Q9NVR0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms