Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms