Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms