Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms