Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms