Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSEN34Q9BSV6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSEN34Q9BSV6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms