Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms