Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2BQ99453 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms