Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms