Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms