Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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