Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC117Q8IWD4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms