Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms