Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms