Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms