Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms