Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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DDB1Q16531 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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DDB1Q16531 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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DDB1Q16531 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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DDB1Q16531 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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DDB1Q16531 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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DDB1Q16531 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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