Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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SCN9AQ15858 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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SCN9AQ15858 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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