Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms