Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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