Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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UBE3CQ15386 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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UBE3CQ15386 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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UBE3CQ15386 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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UBE3CQ15386 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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