Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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