Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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