Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms