Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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