Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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