Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms