Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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